Nasceu na Nazaré a 16 de janeiro de 1973 e iniciou a carreira de futebolista no clube
da terra natal, o GD “Os Nazarenos”. Em 1986 mudou-se para Lisboa a fim de
representar o Sporting CP, onde jogou nos vários escalões até chegar a sénior.
Fez parte da chamada “Geração de Ouro” do futebol português, sagrando-se campeão
mundial sub-20 em Lisboa (1991), torneio em que foi considerado pela FIFA como o
melhor jogador.
Em 1995 transferiu-se do Sporting CP para o Sevilha, tendo regressado a Alvalade em
1996. Um ano depois mudou-se para o FC Porto, tendo representado ainda FC Alverca,
SL Benfica e UD Leiria.
Ao serviço das Seleções Nacionais, Emílio Peixe cumpriu 12 internacionalizações A e 84
na soma de todos os escalões. Em 1989 capitaneou a Equipa das Quinas no Europeu
sub-16 da Dinamarca, que Portugal venceu batendo a RDA na final por 4-1.
Iniciou a carreira de treinador nas seleções de formação da Federação Portuguesa de
Futebol, em 2007, permanecendo desde então na estrutura.