Presidente O atual Presidente da FPF é Fernando Soares Gomes da Silva. Foi eleito a 10 de dezembro de 2011, tendo assumido funções a 17 de dezembro do mesmo ano. Nascido em 1952, é natural da freguesia de Cedofeita, concelho do Porto.
Direção A Direção é composta por 12 membros: o Presidente da FPF, três Vice-Presidentes — um deles, por inerência, o Presidente da Liga Portuguesa de Futebol Profissional — e 8 diretores. Este órgão pode constituir comissões não permanentes de apoio ao exercício das suas competências.